奥素科技的BOXmini™ SCP系统,以实际行动响应“国家大规模设备更新”和“推进高端生命科学仪器国产化”的政策,助力国家生命科学基础研究、创新药物开发和精准医疗落地抢占制高点。
文章通讯作者:中国科学院上海药物研究所(周虎,谢华);中国科学院苏州生物医学工程技术研究所(马汉彬);
JACS Au封面
研究背景:
单细胞组学的兴起,加速了生命科学研究,为诸如发育、衰老、肿瘤与免疫等诸多领域提供了新的认识和见解。过去几年,以单细胞转录组为代表的单细胞测序技术发展迅猛。蛋白质作为细胞生命活动中的主要参与者,在单细胞水平进行全蛋白质组研究,是完善单细胞多组学研究急需填补的空白。
目前,基于质谱的单细胞蛋白质组学,可利用最新一代的质谱设备,实现在广阔动态范围全蛋白组的定性和定量。除高性能的质谱之外,保证实验成功的另一个关键便是高效的单细胞蛋白质样本处理平台:将一个细胞内有限、无法扩增且丰度差异大的全蛋白处理成质谱可检测样本。
本文亮点:
该研究首次提出并实现了一种基于有源矩阵数字微流控芯片(Active-matrix digital microfluidics,AM-DMF)的全流程SCP样本前处理解决方案(AM-DMF-SCP),如图1所示。该平台可以满足高通量单细胞分选、无损样品前处理和与质谱检测无缝衔接的SCP样本前处理需求,具有高效、快速、稳定易用的特点,突破了SCP样本制备的瓶颈,为科研人员提供一个可靠的工具来简化样品制备过程,从而使SCP更加大众化,推动SCP领域的发展。
最后,利用AM-DMF-SCP进行了第三代EGFR抑制剂ASK120067耐药细胞(67R)及其亲本NCI-H1975细胞的单细胞蛋白质组的表征,结果分析得到VIM表达升高与67R耐药之间可能存在关联,这与大量样本分析的结果一致,如图3所示。
上述结果表明,AM-DMF-SCP的提出有效克服了单细胞蛋白质组学样本制备相关的技术障碍困难,以其高效和自动化执行单细胞分选及质谱样品制备过程,纳升级痕量样本反应体系的特点,突破了单细胞蛋白质样本制备的瓶颈。该研究为单细胞蛋白质组样本制备提供了成熟可靠的解决方案,这将成为精准医疗研究领域的一个重要里程碑。
全文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacsau.4c00027?goto=supporting-info
全自动芯片式单细胞蛋白质组学样本制备仪(BOXmini™ SCP)